課題4.マルチプルアライメント(CLUSTALW)
ヒト、マウス、チキンの BCL-2、ヒトの BCL-X、ヒトの BCL-W の5本のアミノ酸配列で、CLUSTAL-W を用いてマルチプアライメントを作成し、保存されている残基を調べる。
手順
DBGET
で SwissProt に対してキーワード検索を行い、上記5つの配列を集める。
あるいは
課題3
にあるように、ヒトの BCL-2 で SwissProt に対してホモロジー検索を行い、必要な配列を集めてもよい。
ブラウザの新しいウインドウに
CLUSTALW
を開く。
SwissProt エントリーの
SQ
リンクから、それぞれの fasta 形式のアミノ酸配列を取得し、それをコピーして順次 CLUSTALW のページのボックスにペーストする。
5本の配列が入力できたら、Exec ボタンを押して実行する。
URL のリスト
CLUSTALW
GenomeNet:
http://clustalw.genome.ad.jp/
バイオインフォマティクス入門コース
Last updated: June 19, 2000